在基层生产基地，桑黄菌种的鉴别主要依据菌丝体、菌落和子实体的形态特征做初步鉴别，有条件的基层生产基地，还可以通过样品比对及显微镜观察。
在正常条件下，经我们初步观察，桑黄菌种菌落初始菌落白色，随着时间的推移慢慢转为微黄色；边缘绒毛状，较老的部位为羊毛状；据专家们实验发现，鲍氏木层孔桑黄菌种对木酚反应不变色，这可能与火木层孔菌桑黄菌种、裂蹄木层孔菌桑黄菌种和粗毛纤孔菌桑黄菌种的区别。
        桑黄菌种的种类真正确切的去识别，无法单纯的依据形态特征及色泽来判断种类及优劣。必须依赖现代生物科技手段进行科学的分析与比对才能识别其桑黄菌种的真实身份。
        据有关报道称，“近年来大型真菌桑黄成为研究和开发的热点,但关于桑黄菌种的确切基源物种,在研究及应用领域却依然没有定论。已有的研究中,认定为桑黄菌种基源物种的真菌超过 7种,均为 P hellinus 属真菌, 其中 研究较多的 为P baumi i、P li nt eus 和 Pi gniar i us。从不同桑黄菌种菌株形态特征比较发现,不同桑黄菌种菌株在菌丝形态上没有显著差异,均为有隔菌丝, 无锁状联合。母种形态特征间有细微色泽差异。菌球形态特征比较发现,P spp-04 与其余菌株形态上有显著差异, 除此之外,其余菌株之间也存在差异, 但这些差异杂乱无序,而且此类性状差异并不稳定, 极易受到生长环境、发育时期等外界因素的影响,甚至在前期究还发现,在培养过程中同一桑黄菌种菌株在不同培养条件、不同生长发育时期出现了不同的外观形态性状。据此可知,不同桑黄菌种菌株菌丝体培养阶段所表现出的形态差异并不能作为有效的菌株鉴定证据”。
        据大量的观察对比发现，不同桑黄菌种的菌丝形态上都比较相似,如果在使用过程中桑黄菌种不做确切的认定，将会给桑黄产品的开发利造成很大的不利。因此,对桑黄菌种的鉴定具有非常重要的意义,这为桑黄产品的开发奠定了基础。因此，引进桑黄菌种，一定到有资质的单位引进，以免带来比必要的损失。